使用 BulkWriter
如果您的数据格式不满足支持的数据格式中列出的各项要求,您可以使用 PyMivus 和 Milvus Java SDK 自带的 BulkWriter 对您的数据进行转换。
概述
BulkWriter 用于将原始数据转换成可以批量导入到目标 Collection 的格式,并在 Zilliz Cloud 控制台、Milvus SDK 的 BulkInsert 接口,以及 RESTful API 的 Import 接口中使用。目前,有如下两种 BulkWriter。
-
LocalBulkWriter 读取指定数据集并将其转换为适用的格式。
-
RemoteBulkWriter 完成 LocalBulkWriter 的所有工作,并将转换后的文件上传到指定的远程对象存储桶中。
使用步骤
安装 PyMilvus
在终端中运行如下命令,安装 PyMilvus 或将其升级到最新版本。
- Python
- Java
python3 -m pip install --upgrade pymilvus
- 如您使用 Apache Maven 管理项目, 在项目的 pom.xml 文件中添加如下内容:
<dependency>
<groupId>io.milvus</groupId>
<artifactId>milvus-sdk-java</artifactId>
<version>2.4.8</version>
</dependency>
- 如您使用 Gradle/Grails 管理项目, 执行如下命令:
compile 'io.milvus:milvus-sdk-java:2.4.8'
创建 Collection Schema
确定需要导入数据的目标 Collection 的 Schema。在此步骤中,您需要确定哪些字段需要被包含在 Schema 中。
下述代码在创建 Schema 时使用了所有可能的数据类型。另外,Schema 中还关闭了 AutoID 并开启了动态字段支持。
- Python
- Java
from pymilvus import MilvusClient, DataType
# You need to work out a collection schema out of your dataset.
schema = MilvusClient.create_schema(
auto_id=False,
enable_dynamic_field=True
)
DIM = 512
schema.add_field(field_name="id", datatype=DataType.INT64, is_primary=True),
schema.add_field(field_name="bool", datatype=DataType.BOOL),
schema.add_field(field_name="int8", datatype=DataType.INT8),
schema.add_field(field_name="int16", datatype=DataType.INT16),
schema.add_field(field_name="int32", datatype=DataType.INT32),
schema.add_field(field_name="int64", datatype=DataType.INT64),
schema.add_field(field_name="float", datatype=DataType.FLOAT),
schema.add_field(field_name="double", datatype=DataType.DOUBLE),
schema.add_field(field_name="varchar", datatype=DataType.VARCHAR, max_length=512),
schema.add_field(field_name="json", datatype=DataType.JSON),
schema.add_field(field_name="array_str", datatype=DataType.ARRAY, max_capacity=100, element_type=DataType.VARCHAR, max_length=128)
schema.add_field(field_name="array_int", datatype=DataType.ARRAY, max_capacity=100, element_type=DataType.INT64)
schema.add_field(field_name="float_vector", datatype=DataType.FLOAT_VECTOR, dim=DIM),
schema.add_field(field_name="binary_vector", datatype=DataType.BINARY_VECTOR, dim=DIM),
schema.add_field(field_name="float16_vector", datatype=DataType.FLOAT16_VECTOR, dim=DIM),
# schema.add_field(field_name="bfloat16_vector", datatype=DataType.BFLOAT16_VECTOR, dim=DIM),
schema.add_field(field_name="sparse_vector", datatype=DataType.SPARSE_FLOAT_VECTOR)
schema.verify()
import io.milvus.param.collection.CollectionSchemaParam;
import io.milvus.param.collection.FieldType;
import io.milvus.grpc.DataType;
private static CreateCollectionReq.CollectionSchema createSchema() {
CreateCollectionReq.CollectionSchema schema = CreateCollectionReq.CollectionSchema.builder()
.enableDynamicField(true)
.build();
schema.addField(AddFieldReq.builder()
.fieldName("id")
.dataType(io.milvus.v2.common.DataType.Int64)
.isPrimaryKey(Boolean.TRUE)
.autoID(false)
.build());
schema.addField(AddFieldReq.builder()
.fieldName("bool")
.dataType(DataType.Bool)
.build());
schema.addField(AddFieldReq.builder()
.fieldName("int8")
.dataType(DataType.Int8)
.build());
schema.addField(AddFieldReq.builder()
.fieldName("int16")
.dataType(DataType.Int16)
.build());
schema.addField(AddFieldReq.builder()
.fieldName("int32")
.dataType(DataType.Int32)
.build());
schema.addField(AddFieldReq.builder()
.fieldName("int64")
.dataType(DataType.Int64)
.build());
schema.addField(AddFieldReq.builder()
.fieldName("float")
.dataType(DataType.Float)
.build());
schema.addField(AddFieldReq.builder()
.fieldName("double")
.dataType(DataType.Double)
.build());
schema.addField(AddFieldReq.builder()
.fieldName("varchar")
.dataType(DataType.VarChar)
.maxLength(512)
.build());
schema.addField(AddFieldReq.builder()
.fieldName("json")
.dataType(io.milvus.v2.common.DataType.JSON)
.build());
schema.addField(AddFieldReq.builder()
.fieldName("array_int")
.dataType(io.milvus.v2.common.DataType.Array)
.maxCapacity(100)
.elementType(io.milvus.v2.common.DataType.Int64)
.build());
schema.addField(AddFieldReq.builder()
.fieldName("array_str")
.dataType(io.milvus.v2.common.DataType.Array)
.maxCapacity(100)
.elementType(io.milvus.v2.common.DataType.VarChar)
.maxLength(128)
.build());
schema.addField(AddFieldReq.builder()
.fieldName("float_vector")
.dataType(io.milvus.v2.common.DataType.FloatVector)
.dimension(DIM)
.build());
schema.addField(AddFieldReq.builder()
.fieldName("binary_vector")
.dataType(io.milvus.v2.common.DataType.BinaryVector)
.dimension(DIM)
.build());
schema.addField(AddFieldReq.builder()
.fieldName("float16_vector")
.dataType(io.milvus.v2.common.DataType.Float16Vector)
.dimension(DIM)
.build());
schema.addField(AddFieldReq.builder()
.fieldName("sparse_vector")
.dataType(io.milvus.v2.common.DataType.SparseFloatVector)
.build());
return schema;
}
private static byte[] genBinaryVector() {
Random ran = new Random();
int byteCount = DIM / 8;
ByteBuffer vector = ByteBuffer.allocate(byteCount);
for (int i = 0; i < byteCount; ++i) {
vector.put((byte) ran.nextInt(Byte.MAX_VALUE));
}
return vector.array();
}
创建 BulkWriter
PyMilvus 中有两种 BulkWriter。在本小节中,我们将了解如何创建这两种 BulkWriter。
-
LocalBulkWriter
LocalBulkWriter 将原始数据按行添加到缓存中,然后将缓存中的数据存入一个指定格式的本地文件中。
- Python
- Java
from pymilvus.bulk_writer import LocalBulkWriter, BulkFileType
# 如果您的集群和 Milvus 2.4.2 及之后版本兼容
# 需使用 `from pymilvus import LocalBulkWriter, BulkFileType`
writer = LocalBulkWriter(
schema=schema,
local_path='.',
segment_size=512 * 1024 * 1024, # default value
file_type=BulkFileType.PARQUET
)在创建 LocalBulkWriter 时,您应该:
-
在 schema 参数中引用之前创建好的 CollectionSchema 对象。
-
在 local_path 中指定本地输出路径。
-
在 file_type 中指定输出文件格式。
-
如果原始数据中包含大量的数据记录,可以考虑设置 segment_size 来调整原始数据分段大小。
关于参数设置,可以参考 SDK Reference 中关于 LocalBulkWriter 的介绍。
📘说明使用 LocalBulkWriter 生成的 JSON 文件可以直接在 Zilliz Cloud 控制台上导入。
如需导入其它格式的文件,需要先将它们上传到和集群同云的对象存储桶中。
import io.milvus.bulkwriter.LocalBulkWriter;
import io.milvus.bulkwriter.LocalBulkWriterParam;
import io.milvus.bulkwriter.common.clientenum.BulkFileType;
LocalBulkWriterParam bulkWriterParam = LocalBulkWriterParam.newBuilder()
.withCollectionSchema(collectionSchema)
.withLocalPath(".")
.withFileType(BulkFileType.PARQUET)
.withChunkSize(512 * 1024 * 1024) // 默认值
.build();
LocalBulkWriter localBulkWriter = new LocalBulkWriter(bulkWriterParam)在创建 LocalBulkWriter 时,您应该:
-
在 withCollectionSchema() 中引用之前创建好的 CollectionSchema 对象。
-
在 withLocalPath() 中指定本地输出路径。
-
在 withFileType() 中设置输出文件类型为 BulkFileType.PARQUET。
-
如果原始数据中包含大量的数据记录,可以考虑在 withChunkSize() 中设置原始数据分段大小。
📘说明Milvus Java SDK 的 BulkWriter 使用 Apache Parquet 作为唯一支持的数据输出格式。
-
RemoteBulkWriter
和 LocalBulkWriter 不同的是,RemoteBulkWriter 将缓存中的数据写入一个远程对象存储桶中。因此,您需要先设置好用于连接该存储桶的 ConnectParam 对象,并在创建 RemoteBulkWriter 时引用该 ConnectParam 对象。
- Python
- Java
from pymilvus.bulk_writer import RemoteBulkWriter
# Use `from pymilvus import RemoteBulkWriter`
# when you use pymilvus earlier than 2.4.2
# Third-party constants
ACCESS_KEY="bucket-ak"
SECRET_KEY="bucket-sk"
BUCKET_NAME="a-bucket"
# Connections parameters to access the remote bucket
conn = RemoteBulkWriter.S3ConnectParam(
endpoint="s3.amazonaws.com", # use 'storage.googleapis.com' for Google Cloud Storage
access_key=ACCESS_KEY,
secret_key=SECRET_KEY,
bucket_name=BUCKET_NAME,
secure=True
)
from pymilvus.bulk_writer import BulkFileType
# Use `from pymilvus import BulkFileType`
# when you use pymilvus earlier than 2.4.2
writer = RemoteBulkWriter(
schema=schema,
remote_path="/",
connect_param=conn,
file_type=BulkFileType.PARQUET
)
print('bulk writer created.')import io.milvus.bulkwriter.connect.S3ConnectParam;
import io.milvus.bulkwriter.connect.StorageConnectParam;
// Configs for remote bucket
String ACCESS_KEY = "";
String SECRET_KEY = "";
String BUCKET_NAME = "";
// Create a remote bucket writer.
StorageConnectParam storageConnectParam = S3ConnectParam.newBuilder()
.withEndpoint("storage.googleapis.com")
.withBucketName(BUCKET_NAME)
.withAccessKey(ACCESS_KEY)
.withSecretKey(SECRET_KEY)
.build();在连接参数准备就绪后,就可以在 RemoteBulkWriter 中引用了。
- Python
- Java
from pymilvus.bulk_writer import RemoteBulkWriter
# Use `from pymilvus import RemoteBulkWriter`
# when you use pymilvus earlier than 2.4.2
writer = RemoteBulkWriter(
schema=schema,
remote_path="/",
connect_param=conn,
file_type=BulkFileType.PARQUET
)import io.milvus.bulkwriter.RemoteBulkWriter;
import io.milvus.bulkwriter.RemoteBulkWriterParam;
import io.milvus.bulkwriter.common.clientenum.BulkFileType;
RemoteBulkWriterParam remoteBulkWriterParam = RemoteBulkWriterParam.newBuilder()
.withCollectionSchema(schema)
.withRemotePath("/")
.withChunkSize(1024 * 1024 * 1024)
.withConnectParam(storageConnectParam)
.withFileType(BulkFileType.PARQUET)
.build();
RemoteBulkWriter remoteBulkWriter = new RemoteBulkWriter(remoteBulkWriterParam);
除了 connect_param 参数外,RemoteBulkWriter 的参数与 LocalBulkWriter 基本相同。更多关于参数设置的信息,可以参考 SDK Reference 中关于 RemoteBulkWriter 的介绍。
开始转换
- Python
- Java
BulkWriter 对象提供两个方法:append_row() 将原始数据按行添加到缓存中,commit() 将缓存中的数据写入一个本地文件或远程对象存储桶中。
为了方便演示,下述代码向缓存中添加随机生成的数据。
import random, string, json
import numpy as np
import tensorflow as tf
def generate_random_str(length=5):
letters = string.ascii_uppercase
digits = string.digits
return ''.join(random.choices(letters + digits, k=length))
# optional input for binary vector:
# 1. list of int such as [1, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0]
# 2. numpy array of uint8
def gen_binary_vector(to_numpy_arr):
raw_vector = [random.randint(0, 1) for i in range(DIM)]
if to_numpy_arr:
return np.packbits(raw_vector, axis=-1)
return raw_vector
# optional input for float vector:
# 1. list of float such as [0.56, 1.859, 6.55, 9.45]
# 2. numpy array of float32
def gen_float_vector(to_numpy_arr):
raw_vector = [random.random() for _ in range(DIM)]
if to_numpy_arr:
return np.array(raw_vector, dtype="float32")
return raw_vector
# # optional input for bfloat16 vector:
# # 1. list of float such as [0.56, 1.859, 6.55, 9.45]
# # 2. numpy array of bfloat16
# def gen_bf16_vector(to_numpy_arr):
# raw_vector = [random.random() for _ in range(DIM)]
# if to_numpy_arr:
# return tf.cast(raw_vector, dtype=tf.bfloat16).numpy()
# return raw_vector
# optional input for float16 vector:
# 1. list of float such as [0.56, 1.859, 6.55, 9.45]
# 2. numpy array of float16
def gen_fp16_vector(to_numpy_arr):
raw_vector = [random.random() for _ in range(DIM)]
if to_numpy_arr:
return np.array(raw_vector, dtype=np.float16)
return raw_vector
# optional input for sparse vector:
# only accepts dict like {2: 13.23, 45: 0.54} or {"indices": [1, 2], "values": [0.1, 0.2]}
# note: no need to sort the keys
def gen_sparse_vector(pair_dict: bool):
raw_vector = {}
dim = random.randint(2, 20)
if pair_dict:
raw_vector["indices"] = [i for i in range(dim)]
raw_vector["values"] = [random.random() for _ in range(dim)]
else:
for i in range(dim):
raw_vector[i] = random.random()
return raw_vector
for i in range(10000):
writer.append_row({
"id": np.int64(i),
"bool": True if i % 3 == 0 else False,
"int8": np.int8(i%128),
"int16": np.int16(i%1000),
"int32": np.int32(i%100000),
"int64": np.int64(i),
"float": np.float32(i/3),
"double": np.float64(i/7),
"varchar": f"varchar_{i}",
"json": json.dumps({"dummy": i, "ok": f"name_{i}"}),
"array_str": np.array([f"str_{k}" for k in range(5)], np.dtype("str")),
"array_int": np.array([k for k in range(10)], np.dtype("int64")),
"float_vector": gen_float_vector(True),
"binary_vector": gen_binary_vector(True),
"float16_vector": gen_fp16_vector(True),
# "bfloat16_vector": gen_bf16_vector(True),
"sparse_vector": gen_sparse_vector(True),
f"dynamic_{i}": i,
})
if (i+1)%1000 == 0:
writer.commit()
print('committed')
一个 BulkWriter 有两个方法,分别为用于添加源数据的 appendRow() 以及用于写入本地文件或远程桶的 commit()。
出于演示目的,如下代码将插入随机生成的数据。
- 主程序
- 随机数据生成器
import com.google.gson.Gson;
import com.google.gson.JsonObject;
import io.milvus.common.utils.Float16Utils;
import java.io.IOException;
import java.nio.ByteBuffer;
import java.util.*;
import java.util.concurrent.TimeUnit;
private static List<List<String>> uploadData() throws Exception {
CreateCollectionReq.CollectionSchema collectionSchema = createSchema();
try (RemoteBulkWriter remoteBulkWriter = createRemoteBulkWriter(collectionSchema)) {
for (int i = 0; i < 10000; ++i) {
JsonObject rowObject = new JsonObject();
rowObject.addProperty("id", i);
rowObject.addProperty("bool", i % 3 == 0);
rowObject.addProperty("int8", i % 128);
rowObject.addProperty("int16", i % 1000);
rowObject.addProperty("int32", i % 100000);
rowObject.addProperty("int64", i);
rowObject.addProperty("float", i / 3);
rowObject.addProperty("double", i / 7);
rowObject.addProperty("varchar", "varchar_" + i);
rowObject.addProperty("json", String.format("{\"dummy\": %s, \"ok\": \"name_%s\"}", i, i));
rowObject.add("array_str", GSON_INSTANCE.toJsonTree(genStringArray(5)));
rowObject.add("array_int", GSON_INSTANCE.toJsonTree(genIntArray(10)));
rowObject.add("float_vector", GSON_INSTANCE.toJsonTree(genFloatVector()));
rowObject.add("binary_vector", GSON_INSTANCE.toJsonTree(genBinaryVector()));
rowObject.add("float16_vector", GSON_INSTANCE.toJsonTree(genFloat16Vector()));
rowObject.add("sparse_vector", GSON_INSTANCE.toJsonTree(genSparseVector()));
rowObject.addProperty("dynamic", "dynamic_" + i);
remoteBulkWriter.appendRow(rowObject);
if ((i+1)%1000 == 0) {
remoteBulkWriter.commit(false);
}
}
List<List<String>> batchFiles = remoteBulkWriter.getBatchFiles();
System.out.println(batchFiles);
return batchFiles;
} catch (Exception e) {
throw e;
}
}
private static byte[] genBinaryVector() {
Random ran = new Random();
int byteCount = DIM / 8;
ByteBuffer vector = ByteBuffer.allocate(byteCount);
for (int i = 0; i < byteCount; ++i) {
vector.put((byte) ran.nextInt(Byte.MAX_VALUE));
}
return vector.array();
}
private static List<Float> genFloatVector() {
Random ran = new Random();
List<Float> vector = new ArrayList<>();
for (int i = 0; i < DIM; ++i) {
vector.add(ran.nextFloat());
}
return vector;
}
private static byte[] genFloat16Vector() {
List<Float> originalVector = genFloatVector();
return Float16Utils.f32VectorToFp16Buffer(originalVector).array();
}
private static SortedMap<Long, Float> genSparseVector() {
Random ran = new Random();
SortedMap<Long, Float> sparse = new TreeMap<>();
int dim = ran.nextInt(18) + 2; // [2, 20)
for (int i = 0; i < dim; ++i) {
sparse.put((long)ran.nextInt(1000000), ran.nextFloat());
}
return sparse;
}
private static List<String> genStringArray(int length) {
List<String> arr = new ArrayList<>();
for (int i = 0; i < length; i++) {
arr.add("str_" + i);
}
return arr;
}
private static List<Long> genIntArray(int length) {
List<Long> arr = new ArrayList<>();
for (long i = 0; i < length; i++) {
arr.add(i);
}
return arr;
}
在上述代码中 vector
和 scalar_1
字段的值由两个名为 generateFloatVectors()
和 generateString()
的私有方法生成。具体请参考随机数据生成器页签。
动态字段支持
在上一节中,我们创建 BulkWriter 时引用了一个启用了动态字段的 Schema。因此,我们可以在使用 BulkWriter 向缓存中添加数据时携带 Schema 中未定义的字段。
为了方便演示,下述代码向缓存中添加随机生成的数据。
- Python
- Java
import random
import string
def generate_random_string(length=5):
letters = string.ascii_uppercase
digits = string.digits
return ''.join(random.choices(letters + digits, k=length))
for i in range(10000):
writer.append_row({
"id": i,
"vector":[random.uniform(-1, 1) for _ in range(768)],
"dynamic_field_1": random.choice([True, False]),
"dynamic_field_2": random.randint(0, 100)
})
writer.commit()
- 主程序
- 随机数据生成器
import java.util.Random
List<JSONObject> data = new ArrayList<>();
for (int i=0; i<10000; i++) {
Random rand = new Random();
JSONObject row = new JSONObject();
row.put("id", Long.valueOf(i));
row.put("vector", generateFloatVectors(768);
row.put("dynamic_field_1", rand.nextBoolean());
row.put("dynamic_field_2", rand.nextInt(100));
remoteBulkWriter.appendRow(row);
}
remoteBulkWriter.commit()
private static List<float> generateFloatVectors(int dimension) {
List<float> vector = new ArrayList();
for (int i=0; i< dimension; i++) {
Random rand = new Random();
vector.add(rand.nextFloat())
}
return vector
}
private static String generateString(length) {
byte[] array = new byte[length];
new Random().nextBytes(array);
return new String(array, Charset.forName("UTF-8"));
}
验证结果
您可以通过打印 BulkWriter 的 data_path 属性来获取实际输出路径。
- Python
- Java
print(writer.data_path)
# LocalBulkWriter
# 'folder/45ae1139-1d87-4aff-85f5-0039111f9e6b'
# RemoteBulkWriter
# '/folder/5868ba87-743e-4d9e-8fa6-e07b39229425'
import java.util.List;
List<List<String>> batchFiles = remoteBulkWriter.getBatchFiles();
System.out.println(batchFiles);
// [["/5868ba87-743e-4d9e-8fa6-e07b39229425/1.parquet"]]
BulkWriter 生成一个 UUID,并使用该 UUID 在指定的输入路径下创建一个子路径,然后将生成的文件放在创建的子路径下。您也可以单击此处下载根据上述部署生成的示例数据文件。
生成的数据目录结构如下所示:
-
如果待转换数据大小未超过创建 BulkWriter 时指定的分段大小。
# JSON
├── folder
│ └── 45ae1139-1d87-4aff-85f5-0039111f9e6b
│ └── 1.json
# Parquet
├── folder
│ └── 45ae1139-1d87-4aff-85f5-0039111f9e6b
│ └── 1.parquet
# Numpy
├── folder
│ └── 45ae1139-1d87-4aff-85f5-0039111f9e6b
│ ├── id.npy
│ ├── vector.npy
│ ├── scalar_1.npy
│ ├── scalar_2.npy
│ └── $meta.npy则对应的导入文件路径如下:
文件类型
合法的文件导入路径
JSON
Parquet
NumPy